1977年毕业于上海第一医学院,临床医学专业。1993年晋生为副主任医师,2000年7月晋生为主任医师。1992年7月赴美国哥仑比亚大学内、外科学院传染病科进修1年。主要从事感染性疾病的临床诊治及抗菌药物的临床研究工作。吴菊芳教授长期工作于临床第一线,承担本院及院外的难治感染疾病的会诊,完成新抗菌药物的临床评价等课题10余个。国内发表论文有“头孢呋新--有临床前途的头孢菌素”、“氨苄西林/舒巴坦的临床评价”等12篇。另有“新氟喹诺酮类抗菌药物的体外抗菌作用”等论文,被收入于国际会议的论文集。1995年已获硕士研究生导师资格。