胎儿肾盂分离超过1cm，建议进行以下处理：观察等待：如果分离是生理性的，随着胎儿的发育和尿液的排出，肾盂分离可能会逐渐消失。因此，在胎儿肾盂分离不超过1cm的情况下，建议孕妇定期到医院进行产检，及时关注胎儿的生长发育情况。
宫内治疗或宫外治疗：如果胎儿肾盂分离超过1cm，并且持续时间较长，同时伴有其他症状如羊水过多或过少等，这可能表明胎儿的肾脏发育存在异常。此时应考虑进行宫内治疗或宫外治疗。宫内治疗通常是指胎儿镜手术，如经皮膀胱、肾盂的羊膜分离术等。宫外治疗则是在胎儿出生后，根据具体情况选择手术治疗。
此外，孕妇在日常生活中需要注意补充营养元素，如锌、镁、碘、铜等，还可以多吃黄豆、花生等，这些食物含有大量可消化蛋白质、维生素B、维生素C等，能够维持孕妇机体的正常运转以及帮助胎儿正常生长发育。以上信息仅供参考，建议咨询专业医生。